Serveur OMERO

OMERO permet de stocker toutes vos images à un seul endroit et ce, de façon sécuritaire. Vous pouvez sauvegarder, voir, organiser, analyser et partager vos images partout où vous avez accès à Internet. OMERO vous permet de pouvoir travailler avec vos images en utilisant une application installable sur votre ordinateur (Windows, Mac et Linux), à partir d'un fureteur Internet ou via certaines applications tierces. Plus de 140 formats d'images sont supportés, incluant la majorité des formats utilisés en microscopie.

Site officiel (en anglais)

Vous pouvez utiliser OMERO.web ou le client OMERO.insight afin de voir, organiser et partager vos données. Si vous avez besoin d'aide avec le serveur OMERO ou si vous désirer avoir votre compte sur le serveur OMERO, contactez Louis Gendron.

Aide pour le serveur OMERO :

1. Installation du client OMERO.insight (Windows, Mac, Linux)
   • Télécharger le client OMERO.
   • L'adresse du serveur est "omero.ccs.usherbrooke.ca" (vous en aurez besoin lors des prochaines étapes).
   • Suivre les instructions.
2. Changer votre mot de passe avec OMERO.web
   • Cliquer sur votre nom apparaissant en haut à droite de l'écran.
   • Sélectionner "User Settings".
   • Cliquer sur le bouton "Change Password" dans le bas de la page.
     
     
3. Télécharger des images se trouvant sur le serveur avec OMERO.web et le client OMERO.insight
   • Sélectionner une ou des images.
   • Cliquer sur la flèche se trouvant en haut du panneau de droite.
   • Sélectionner "Download..." pour télécharger le format original ou choisisser le format désiré.
4. Téléverser des images sur le serveur OMERO
   Vous devez utiliser le client OMERO.insight pour téléverser des images sur le serveur OMERO
   • Dans OMERO.insight, ouvrir "Importer" en cliquant sur la flèche bleue avec trois points.
     
     
     
     
   • Dans la fenêtre "Import Data" :
     • Dans le panneau de gauche, naviguer à l'endroit où se trouvent vos images.
     • Sélectionner les images ou les dossiers contenant les images que vous voulez importer sur le serveur.
     • Cliquer sur la flèche se trouvant entre les deux panneaux afin de confirmer la sélection.
     • Sélectionner ou créer un "Projet" (les projets correspondent aux dossiers principaux).
     • Sélectionner ou créer un "Dataset" (les datasets correspondent aux sous-dossiers).
     • Cliquer sur "Add to the Queue".
     • Vous pouvez visualiser un résumé des images qui seront envoyées et dans quelles projet/dataset elles seront mises.
     • Cliquer sur "Import" afin d'envoyer vos images sur le serveur.
   • Une fois le téléversement terminé, assurez-vous de cliquer sur "Refresh the tree" si vous voulez voir vos images.
   • Plus d'informations.
5. Voir les images d'autres utilisateurs
   • À noter que vous pouvez uniquement voir les images des personnes étant dans le même groupe (laboratoire) que vous.
   • Avec OMERO.web
     • Cliquer à l'endroit où on voit le nom de l'utilisateur en haut du panneau de gauche.
     • Sélectionner le groupe et l'utilisateur désiré.
       
       
   • Avec le client OMERO.insight
     • Cliquer sur "Display Groups" en haut de la fenêtre.
     • Sélectionner le groupe et l'utilisateur désiré (plusieurs groupes et utilisateurs peuvent être sélectionnés simultanément)